SUU, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 386: MFU spm. om, hvor mange personer der var smittet med de omtalte minkvarianter af COVID-19 fordelt på hver enkelt nordjysk kommune, til sundheds- og ældreministeren

Sundhedsudvalget 2020-21
SUU Alm.del
Offentligt

20. januar 2021

Notat om den seneste udvikling af SARS-CoV-2 på

minkfarme og blandt mennesker

Notatet indeholder afsnit om regional forekomst af covid-19 i befolkningen fra uge 24

2020 til uge 1 2021 samt fund af minkvariant blandt sekventerede prøver i ugerne 33-52

2020. Minkvarianten defineres som virustyper, der indeholder mutationen Y453F i

spikeproteinet, da sekvenser med denne mutation kan spores tilbage til de første udbrud

på minkfarme og hos personer i Nordjylland.

Afsnittet om smittede personer med relation til minkproduktion og smittede minkfarme

udgår som følge af aflivning af alle danske mink. Risiko for smitte blandt personer med

relation til minkproduktion vurderes herefter at være på samme niveau som

baggrundsbefolkningen. Da der ikke er fortsat minkproduktion i Danmark, vil smitte i

denne befolkningsgruppe skyldes samfundssmitte, og ikke smitte fra mink. Der henvises

til tidligere notater for beskrivelse af smittede minkfarme og smittede personer med

relation til minkproduktion.

Der arbejdes fortsat på udbrudsudredning af smitte blandt pelseriarbejdere. Resultaterne

vil blive udgivet selvstændigt, når databearbejdning er færdig.

Sammenfatning

Den seneste opgørelse over minkvariant i samfundet viser, at i takt med at aflivning af

mink både til pelsning og til destruktion er færdiggjort, er andelen af minkvariant blandt

sekventerede prøver i samfundet faldet gradvist efterfølgende, og er nu på et meget lavt

niveau i alle regioner. Forekomst af minkvarianten har vist et nøje sammenfald med

forekomsten af smittede minkbesætninger. Da der for nuværende ikke avles mink i

Danmark, forventes derfor ikke en stigning i forekomsten af minkvarianten fremover.

Varianten overvåges fortsat rutinemæssigt.

SARS-CoV-2 og minkvariant i samfundet

I hele perioden har Region Nordjylland haft den største andel af minkvariant blandt

sekventerede humane prøver, som følge af det omfattende udbrud på minkfarme i

regionen (se tidligere notater). Men Region Midtjylland har haft det største estimerede

antal personer smittet med minkvariant.

Udbrud med SARS-CoV-2 i minkfarme i Region Midtjylland (uge 40) og Region

Syddanmark (uge 43) skete senere end i Region Nordjylland (uge 33), og antallet af

smittede minkbesætninger var i stigning i adskillige kommuner i Region Midtjylland og

Syddanmark samtidigt, da aflivning af alle danske mink blev iværksat.



I Region Nordjylland svingede andelen af minkvariant blandt sekventerede

prøver, men størst var andelen i ugerne 41 og 42, hvor minkvariant udgjorde hhv.

51% og 60% af de sekventerede prøver. Fra uge 45-47 sås en stigende tendens fra

22% til 33%.

SUU, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 386: MFU spm. om, hvor mange personer der var smittet med de omtalte minkvarianter af COVID-19 fordelt på hver enkelt nordjysk kommune, til sundheds- og ældreministeren



I Region Midtjylland toppede andelen af minkvariant i uge 46 og 47 med hhv.

30% og 29% af de sekventerede prøver.

I Region Syddanmark toppede andelen af minkvariant i uge 46-48 med hhv. 11%,

13% og 9% af de sekventerede prøver.

I de øvrige regioner, hvor der ikke er fundet smittede minkfarme, har tilfælde med

minkvariant været sporadisk forekommende.

I de tre jyske regioner, hvor de smittede minkfarme befandt sig, sås en stigning i andelen

af minkvariant i samfundet i ugerne 46-47. Denne stigning faldt sammen med en voldsom

stigning i antal smittede personer med tilknytning til minkproduktion - en stigning, der

faldt sammen med aflivning af mink til destruktion og pelsning. I de tre jyske regioner

sås et samtidigt gradvist fald i den andel minkvarianten udgjorde af det samlede antal

SARS-CoV-2-positive prøver fra uge 48 og frem, da aflivning af mink var gennemført i

uge 47 (figur 1.b-3.b). Sammenfaldende for de tre jyske regioner, har forekomsten af

minkvarianten ligget på et meget lavt niveau fra uge 52 og frem, i alt 5 tilfælde af 784

sekventerede prøver, svarende til 0,64% (figur 1.b-3.b). Da kun ca. 22% af de positive

prøver blev sekventeret, vil der formentlig reelt have været ca. 4,5 gange flere tilfælde

forårsaget af minkvarianten i perioden (tabel 1.a). Disse resultater understøtter

forventningen om, at minkvarianten enten gradvist vil forsvinde eller stabilisere sig på et

meget lavt niveau, efter eliminering af mink som smittekilde.

Den generelle udvikling i forekomst af smitte med SARS-CoV-2 i Region Nordjylland

adskiller sig fra Region Midtjylland og Syddanmark ved, at der sås et midlertidigt fald i

antal bekræftede tilfælde i ugerne 44-48 (figur 1.a-3.a). Et lignende fald sås ikke i Region

Midtjylland og Region Syddanmark. Faldet var startet ugen før indførelse af

restriktionerne i Region Nordjylland i uge 45.Den efterfølgende stigning i forekomsten

af smitte med SARS-CoV-2 i Region Nordjylland sås fra uge 49, svarende til 1-2 uger

efter lempelse af restriktionerne fra d. 20-23. november (figur 1.a)

Der sekventeres løbende flere virusprøver fra tidligere uger, hvorved resultaterne for de

pågældende uger ændres en smule tilbage i tid. Dertil kommer, at der er opsat en ny

kvalitetssikringsprocedure af prøveresultater på Aalborg Universitet. Det betyder at nogle

prøveresultater, der har været inkludereret i tidligere rapporter, nu er blevet ekskluderet.

Disse ændringer har ikke haft betydning for estimaterne, og de nye resultater har ligget

inden for de tidligere angivne konfidensintervaller, og giver ikke anledning til at ændre

konklusioner i tidligere udgaver af notatet. Da der har været regionale forskelle i

forekomst af minkvariant og andel af prøver, der sekventeres, bør estimaterne betragtes

regionsvist (figur 5.a-7.b, tabel 3.a-c).

Nye sekvenstyper fundet i mink.

Der er fundet minkfarme i Region Syddanmark og Midtjylland smittet med

andrevarianter end minkvarianten. Der tages derfor forbehold for, at nærværende

opgørelser, der kun baseres på minkvarianten som kilde til smitte af mennesker med

SARS-CoV-2 fra mink, kan være en underestimering af minkfarmenes betydning for

smitte i samfundet.

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 2

Region Nordjylland:

I Region Nordjylland sås en faldende tendens i forekomsten af

påvist SARS-CoV-2 i befolkningen fra uge 44 til uge 48, men antallet steg igen fra uge

49 og toppede foreløbigt i uge 51 (figur 1.a). Den relative forekomst af SARS-CoV-2

minkvariant faldt fra uge 41 til uge 44, og steg igen i ugerne 44-47 fra 22% til 33%. (figur

1.b). Siden uge 47 er andelen af minkvariant faldet markant og vurderes at ligge på et

meget lavt niveau (tabel 1.a).

1600

1400

1200

Antal bekræftede tilfælde

1000

800

Ikke sekventeret

Ikke minkvariant

600

Minkvariant

400

200

24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1

Uge

Figur 1.a:

Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Nordjylland, uge 24

2020 - uge 1 2021. Rød/gul: Antal sekventerede prøver.

100%

90%

Antal bekræftede tilfælde

80%

70%

60%

50%

40%

30%

20%

10%

Minkvariant

Ikke minkvariant

33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1

1 7 7 5 6 16 14 28 72 16 52 50 89 80 33 8 4 12 1 4 0

Ikke minkvariant 29 18 18 21 39 69 64 26 19 67 24 184170218164136 56 93 282348256175

Minkvariant

Uge

Figur 1.b:

Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr.

uge i Region Nordjylland, uge 31-1, 2021.

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 3

Region Midtjylland:

I Region Midtjylland har der i efteråret været en støt stigning i

antallet af bekræftede tilfælde, med en markant stigning i uge 50 og en foreløbig top i

uge 51 (figur 2.a). Det første tilfælde med minkvariant sås i uge 40, med en stigende

forekomst frem mod uge 46 og 47, hvor andelen af SARS-CoV-2 minkvariant udgjorde

henholdsvis 30% og 28% af de sekventerede prøver (figur 2.b). I ugerne 48-51 er den

relative andel af minkvariant faldet, og har derefter ligget på et meget lavt niveau (tabel

1.b).

5000

4500

4000

Antal bekræftede tilfælde

3500

3000

2500

2000

Minkvariant

1500

1000

500

24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1

Ikke sekventeret

Ikke minkvariant

Uge

Figur 2.a:

Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Midtjylland, uge 24

2020 - uge 1 2021. Rød/gul: Antal sekventerede prøver.

100%

90%

Antal bekræftede tilfælde

80%

70%

60%

50%

40%

30%

20%

10%

Minkvariant

Ikke minkvariant

33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1

0 0 0 0 0 0 1 2 6 4 21 31 82 84 33 17 9 5 1 1 0

Ikke minkvariant 185100 62 61 28 84 99 81 103202 52 165210188219297384448636316310293

Minkvariant

Uge

Figur 2.b:

Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr.

uge i Region Midtjylland, uge 31-1, 2021.

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 4

Region Syddanmark:

I Region Syddanmark har der været en støt stigning i antallet af

ugentlige bekræftede tilfælde med en foreløbig top i uge 51 (figur 3.a). Det første tilfælde

med minkvariant sås i uge 43. I uge 46 og 47 var andelen af minkvariant i de positive

prøver steget til hhv. 12% og 13% af de sekventerede prøver (figur 3.b). Der er i de

efterfølgende uger set et fald i andelen af minkvariant og der er ikke fundet prøver med

minkvariant i ugerne 51-1 (tabel 3.c).

3500

3000

Antal bekræftede tilfælde

2500

2000

Ikke sekventeret

1500

Ikke minkvariant

Minkvariant

1000

500

24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1

Uge

Figur 3.a:

Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Syddanmark, uge 24

2020 - uge 1 2021. Rød/gul: Antal sekventerede prøver.

100%

90%

Antal bekræftede tilfælde

80%

70%

60%

50%

40%

30%

20%

10%

Minkvariant

Ikke minkvariant

33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1

0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 3 4 20 33 19 7 2 0 1 0 0

Ikke minkvariant 34 41 47 128 69 169215 89 48 148 43 172179143226177220530472533523367

Minkvariant

Uge

Figur 3.b:

Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr.

uge i Region Syddanmark, uge 31-1, 2021.

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 5

Andelen af prøver, der er blevet sekventeret varierede fra 5-71% mellem forskellige uger

og regioner (tabel 1.a-c) og andelen af minkvariant af de sekventerede prøver varierede

ligeledes mellem forskellige uger og regioner. Derfor betragtes estimaterne regionsvis.

Inden for de enkelte regioner foregår der ikke nogen selektion af prøver på person-niveau,

men prøver fra sundhedssporet er underrepræsenteret i forhold til prøver fra

samfundssporet. Det kan muligvis introducere et bias hvis forskellige persongrupper

testes i forskelligt testregi. Når der suppleres med nye sekvensresultater til tidligere

rapporterede uger ændres estimatet for nogle uger en smule, men de nye estimater falder

inden for de tidligere angivne konfidensintervaller.

Det estimerede antal tilfælde af minkvariant i tabellerne 1.a-c er foretaget under en

antagelse om, at andelen af minkvarianter blandt sekventerede prøver er den samme for

alle påviste tilfælde.

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 6

Tabel 1.a:

Region Nordjylland

Antal bekræftede COVID-19-tilfælde, andel af sekventerede prøver, andel af COVID-

19-tilfælde forårsaget af minkvarianten, samt det estimerede antal tilfælde, forårsaget af

minkvarianten pr. uge.

Antal

bekræftede

tilfælde

Antal

Uge 33

Uge 34

Uge 35

Uge 36

Uge 37

Uge 38

Uge 39

Uge 40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

Uge 46

Uge 47

Uge 48

Uge 49

Uge 50

Uge 51

Uge 52

Uge 53

Uge 1

233

331

292

260

295

330

679

818

588

485

357

267

387

964

1422

1303

1222

984

Sekventerede

prøver

Andel (%) af

bekræftede

52%

40%

51%

41%

19%

23%

27%

15%

16%

42%

29%

37%

63%

68%

63%

17%

10%

21%

27%

21%

18%

Minkvariant

Estimeret antal tilfælde

af minkvarianten

Antal (95% CI)

4 (0-13)

3 (0-12)

14 (6-24)

17 (7-31)

26 (9-57)

26 (10-55)

58 (35-89)

91 (54-134)

176 (131-217)

171 (142-199)

272 (169-385)

180 (138-228)

134 (102-170)

141 (116-167)

117 (96-139)

52 (37-70)

48 (21-90)

40 (11-99)

58 (30-100)

4 (0-21)

19 (5-48)

0 (0-21)

Andel i procent

(95% CI)

6% (1-21)

5% (0-26)

28% (12-49)

25% (11-45)

11% (4-25)

8% (3-17)

20% (12-30)

35% (21-52)

60% (44-74)

52% (43-60)

40% (25-57)

22% (17-28)

23% (17-29)

29% (24-34)

33% (27-39)

20% (14-26)

13% (6-23)

4% (1-10)

4% (2-7)

0% (0-2)

2% (0-4)

0% (0-2)

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 7

Tabel 1.b:

Region Midtjylland

Antal bekræftede COVID-19-tilfælde, andel af sekventerede prøver, andel af COVID-

19-tilfælde forårsaget af minkvarianten, samt det estimerede antal tilfælde, forårsaget af

minkvarianten pr. uge

Antal

bekræftede

tilfælde

Antal

Uge 33

Uge 34

Uge 35

Uge 36

Uge 37

Uge 38

Uge 39

Uge 40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

Uge 46

Uge 47

Uge 48

Uge 49

Uge 50

Uge 51

Uge 52

Uge 53

Uge 1

428

221

157

137

233

376

670

648

770

677

1186

1294

1321

1601

1722

1529

2233

3720

4316

2807

2798

2044

Sekventerede

prøver

Andel (%) af

bekræftede

43%

45%

39%

45%

12%

22%

15%

13%

14%

31%

14%

18%

17%

18%

22%

18%

12%

15%

11%

14%

Minkvariant

Estimeret antal tilfælde

af minkvarianten

Antal (95% CI)

2 (0-13)

0 (0-8)

0 (0-9)

0 (0-8)

0 (0-29)

0 (0-16)

0 (0-25)

8 (0-43)

15 (2-52)

20 (7-42)

85 (23-205)

146 (92-217)

170 (118-235)

486 (399-580)

477 (392-570)

153 (107-210)

95 (56-150)

73 (34-138)

34 (11-78)

9 (0-49)

9 (0-50)

0 (0-26)

Andel i procent

(95% CI)

1% (0-3)

0% (0-4)

0% (0-6)

0% (0-12)

0% (0-4)

1% (0-7)

2% (0-7)

3% (1-6)

7% (2-17)

11% (7-17)

13% (9-18)

30% (25-36)

28% (23-33)

10% (7-14)

4% (2-7)

2% (1-4)

1% (0-2)

0% (0-2)

0% (0-1)

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 8

Tabel 1.c:

Region Syddanmark

Antal bekræftede COVID-19-tilfælde, andel af sekventerede prøver, andel af COVID-

19-tilfælde forårsaget af minkvarianten, samt det estimerede antal tilfælde, forårsaget af

minkvarianten pr. uge.

Antal

bekræftede

tilfælde

Antal

Uge 33

Uge 34

Uge 35

Uge 36

Uge 37

Uge 38

Uge 39

Uge 40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

Uge 46

Uge 47

Uge 48

Uge 49

Uge 50

Uge 51

Uge 52

Uge 53

Uge 1

240

327

377

438

387

358

548

826

1024

990

1088

1454

1298

1433

2119

2966

2211

1925

1652

Sekventerede

prøver

Andel (%) af

bekræftede

48%

44%

49%

53%

21%

45%

49%

23%

13%

27%

17%

18%

15%

18%

15%

16%

25%

16%

24%

27%

22%

Minkvariant

Estimeret antal tilfælde

af minkvarianten

Antal (95% CI)

0 (0-7)

0 (0-8)

0 (0-7)

0 (0-17)

0 (0-8)

0 (0-7)

0 (0-16)

0 (0-26)

0 (0-13)

19 (0-99)

18 (4-50)

22 (6-54)

133 (83-199)

185 (130-253)

126 (77-191)

44 (18-90)

8 (1-29)

0 (0-23)

4 (0-23)

0 (0-14)

0 (0-17)

Andel i procent

(95% CI)

0% (0-10)

0% (0-9)

0% (0-8)

0% (0-3)

0% (0-5)

0% (0-2)

0% (0-4)

0% (0-7)

0% (0-2)

2% (0-12)

2% (0-5)

2% (1-6)

12% (8-18)

13% (9-17)

10% (6-15)

3% (1-6)

0% (0-1)

Øvrige regioner.

I Region Sjælland og Region Hovedstaden er der over de seneste uger

Ikke påvist SARS-CoV-2 minkvariant hos smittede personer.

De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)

Side 9