Miljø- og Fødevareudvalget 2020-21
MOF Alm.del
Offentligt
2409476_0001.png
20. januar 2021
Notat om den seneste udvikling af SARS-CoV-2 på
minkfarme og blandt mennesker
Notatet indeholder afsnit om regional forekomst af covid-19 i befolkningen fra uge 24
2020 til uge 1 2021 samt fund af minkvariant blandt sekventerede prøver i ugerne 33-52
2020. Minkvarianten defineres som virustyper, der indeholder mutationen Y453F i
spikeproteinet, da sekvenser med denne mutation kan spores tilbage til de første udbrud
på minkfarme og hos personer i Nordjylland.
Afsnittet om smittede personer med relation til minkproduktion og smittede minkfarme
udgår som følge af aflivning af alle danske mink. Risiko for smitte blandt personer med
relation til minkproduktion vurderes herefter at være på samme niveau som
baggrundsbefolkningen. Da der ikke er fortsat minkproduktion i Danmark, vil smitte i
denne befolkningsgruppe skyldes samfundssmitte, og ikke smitte fra mink. Der henvises
til tidligere notater for beskrivelse af smittede minkfarme og smittede personer med
relation til minkproduktion.
Der arbejdes fortsat på udbrudsudredning af smitte blandt pelseriarbejdere. Resultaterne
vil blive udgivet selvstændigt, når databearbejdning er færdig.
Sammenfatning
Den seneste opgørelse over minkvariant i samfundet viser, at i takt med at aflivning af
mink både til pelsning og til destruktion er færdiggjort, er andelen af minkvariant blandt
sekventerede prøver i samfundet faldet gradvist efterfølgende, og er nu på et meget lavt
niveau i alle regioner. Forekomst af minkvarianten har vist et nøje sammenfald med
forekomsten af smittede minkbesætninger. Da der for nuværende ikke avles mink i
Danmark, forventes derfor ikke en stigning i forekomsten af minkvarianten fremover.
Varianten overvåges fortsat rutinemæssigt.
SARS-CoV-2 og minkvariant i samfundet
I hele perioden har Region Nordjylland haft den største andel af minkvariant blandt
sekventerede humane prøver, som følge af det omfattende udbrud på minkfarme i
regionen (se tidligere notater). Men Region Midtjylland har haft det største estimerede
antal personer smittet med minkvariant.
Udbrud med SARS-CoV-2 i minkfarme i Region Midtjylland (uge 40) og Region
Syddanmark (uge 43) skete senere end i Region Nordjylland (uge 33), og antallet af
smittede minkbesætninger var i stigning i adskillige kommuner i Region Midtjylland og
Syddanmark samtidigt, da aflivning af alle danske mink blev iværksat.
I Region Nordjylland svingede andelen af minkvariant blandt sekventerede
prøver, men størst var andelen i ugerne 41 og 42, hvor minkvariant udgjorde hhv.
51% og 60% af de sekventerede prøver. Fra uge 45-47 sås en stigende tendens fra
22% til 33%.
1
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0002.png
I Region Midtjylland toppede andelen af minkvariant i uge 46 og 47 med hhv.
30% og 29% af de sekventerede prøver.
I Region Syddanmark toppede andelen af minkvariant i uge 46-48 med hhv. 11%,
13% og 9% af de sekventerede prøver.
I de øvrige regioner, hvor der ikke er fundet smittede minkfarme, har tilfælde med
minkvariant været sporadisk forekommende.
I de tre jyske regioner, hvor de smittede minkfarme befandt sig, sås en stigning i andelen
af minkvariant i samfundet i ugerne 46-47. Denne stigning faldt sammen med en voldsom
stigning i antal smittede personer med tilknytning til minkproduktion - en stigning, der
faldt sammen med aflivning af mink til destruktion og pelsning. I de tre jyske regioner
sås et samtidigt gradvist fald i den andel minkvarianten udgjorde af det samlede antal
SARS-CoV-2-positive prøver fra uge 48 og frem, da aflivning af mink var gennemført i
uge 47 (figur 1.b-3.b). Sammenfaldende for de tre jyske regioner, har forekomsten af
minkvarianten ligget på et meget lavt niveau fra uge 52 og frem, i alt 5 tilfælde af 784
sekventerede prøver, svarende til 0,64% (figur 1.b-3.b). Da kun ca. 22% af de positive
prøver blev sekventeret, vil der formentlig reelt have været ca. 4,5 gange flere tilfælde
forårsaget af minkvarianten i perioden (tabel 1.a). Disse resultater understøtter
forventningen om, at minkvarianten enten gradvist vil forsvinde eller stabilisere sig på et
meget lavt niveau, efter eliminering af mink som smittekilde.
Den generelle udvikling i forekomst af smitte med SARS-CoV-2 i Region Nordjylland
adskiller sig fra Region Midtjylland og Syddanmark ved, at der sås et midlertidigt fald i
antal bekræftede tilfælde i ugerne 44-48 (figur 1.a-3.a). Et lignende fald sås ikke i Region
Midtjylland og Region Syddanmark. Faldet var startet ugen før indførelse af
restriktionerne i Region Nordjylland i uge 45.Den efterfølgende stigning i forekomsten
af smitte med SARS-CoV-2 i Region Nordjylland sås fra uge 49, svarende til 1-2 uger
efter lempelse af restriktionerne fra d. 20-23. november (figur 1.a)
1
.
Der sekventeres løbende flere virusprøver fra tidligere uger, hvorved resultaterne for de
pågældende uger ændres en smule tilbage i tid. Dertil kommer, at der er opsat en ny
kvalitetssikringsprocedure af prøveresultater på Aalborg Universitet. Det betyder at nogle
prøveresultater, der har været inkludereret i tidligere rapporter, nu er blevet ekskluderet.
Disse ændringer har ikke haft betydning for estimaterne, og de nye resultater har ligget
inden for de tidligere angivne konfidensintervaller, og giver ikke anledning til at ændre
konklusioner i tidligere udgaver af notatet. Da der har været regionale forskelle i
forekomst af minkvariant og andel af prøver, der sekventeres, bør estimaterne betragtes
regionsvist (figur 5.a-7.b, tabel 3.a-c).
Nye sekvenstyper fundet i mink.
Der er fundet minkfarme i Region Syddanmark og Midtjylland smittet med
andrevarianter end minkvarianten. Der tages derfor forbehold for, at nærværende
opgørelser, der kun baseres på minkvarianten som kilde til smitte af mennesker med
SARS-CoV-2 fra mink, kan være en underestimering af minkfarmenes betydning for
smitte i samfundet.
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0003.png
Region Nordjylland:
I Region Nordjylland sås en faldende tendens i forekomsten af
påvist SARS-CoV-2 i befolkningen fra uge 44 til uge 48, men antallet steg igen fra uge
49 og toppede foreløbigt i uge 51 (figur 1.a). Den relative forekomst af SARS-CoV-2
minkvariant faldt fra uge 41 til uge 44, og steg igen i ugerne 44-47 fra 22% til 33%. (figur
1.b). Siden uge 47 er andelen af minkvariant faldet markant og vurderes at ligge på et
meget lavt niveau (tabel 1.a).
1600
1400
1200
Antal bekræftede tilfælde
1000
800
Ikke sekventeret
Ikke minkvariant
600
Minkvariant
400
200
0
24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1
Uge
Figur 1.a:
Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Nordjylland, uge 24
2020 - uge 1 2021. Rød/gul: Antal sekventerede prøver.
100%
90%
Antal bekræftede tilfælde
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1
2 1 7 7 5 6 16 14 28 72 16 52 50 89 80 33 8 4 12 1 4 0
Minkvariant
Ikke minkvariant
Ikke minkvariant 29 18 18 21 39 69 64 26 19 67 24 184170218164136 56 93 282348256175
Minkvariant
Uge
Figur 1.b:
Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr.
uge i Region Nordjylland, uge 31-1, 2021.
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0004.png
Region Midtjylland:
I Region Midtjylland har der i efteråret været en støt stigning i
antallet af bekræftede tilfælde, med en markant stigning i uge 50 og en foreløbig top i
uge 51 (figur 2.a). Det første tilfælde med minkvariant sås i uge 40, med en stigende
forekomst frem mod uge 46 og 47, hvor andelen af SARS-CoV-2 minkvariant udgjorde
henholdsvis 30% og 28% af de sekventerede prøver (figur 2.b). I ugerne 48-51 er den
relative andel af minkvariant faldet, og har derefter ligget på et meget lavt niveau (tabel
1.b).
5000
4500
4000
Antal bekræftede tilfælde
3500
3000
2500
2000
Minkvariant
1500
1000
500
0
24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1
Ikke sekventeret
Ikke minkvariant
Uge
Figur 2.a:
Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Midtjylland, uge 24
2020 - uge 1 2021. Rød/gul: Antal sekventerede prøver.
100%
90%
Antal bekræftede tilfælde
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1
1 0 0 0 0 0 0 1 2 6 4 21 31 82 84 33 17 9 5 1 1 0
Minkvariant
Ikke minkvariant
Ikke minkvariant 185100 62 61 28 84 99 81 103202 52 165210188219297384448636316310293
Minkvariant
Uge
Figur 2.b:
Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr.
uge i Region Midtjylland, uge 31-1, 2021.
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0005.png
Region Syddanmark:
I Region Syddanmark har der været en støt stigning i antallet af
ugentlige bekræftede tilfælde med en foreløbig top i uge 51 (figur 3.a). Det første tilfælde
med minkvariant sås i uge 43. I uge 46 og 47 var andelen af minkvariant i de positive
prøver steget til hhv. 12% og 13% af de sekventerede prøver (figur 3.b). Der er i de
efterfølgende uger set et fald i andelen af minkvariant og der er ikke fundet prøver med
minkvariant i ugerne 51-1 (tabel 3.c).
3500
3000
Antal bekræftede tilfælde
2500
2000
Ikke sekventeret
1500
Ikke minkvariant
Minkvariant
1000
500
0
24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1
Uge
Figur 3.a:
Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Syddanmark, uge 24
2020 - uge 1 2021. Rød/gul: Antal sekventerede prøver.
100%
90%
Antal bekræftede tilfælde
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 3 4 20 33 19 7 2 0 1 0 0
Minkvariant
Ikke minkvariant
Ikke minkvariant 34 41 47 128 69 169215 89 48 148 43 172179143226177220530472533523367
Minkvariant
Uge
Figur 3.b:
Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr.
uge i Region Syddanmark, uge 31-1, 2021.
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0006.png
Andelen af prøver, der er blevet sekventeret varierede fra 5-71% mellem forskellige uger
og regioner (tabel 1.a-c) og andelen af minkvariant af de sekventerede prøver varierede
ligeledes mellem forskellige uger og regioner. Derfor betragtes estimaterne regionsvis.
Inden for de enkelte regioner foregår der ikke nogen selektion af prøver på person-niveau,
men prøver fra sundhedssporet er underrepræsenteret i forhold til prøver fra
samfundssporet. Det kan muligvis introducere et bias hvis forskellige persongrupper
testes i forskelligt testregi. Når der suppleres med nye sekvensresultater til tidligere
rapporterede uger ændres estimatet for nogle uger en smule, men de nye estimater falder
inden for de tidligere angivne konfidensintervaller.
Det estimerede antal tilfælde af minkvariant i tabellerne 1.a-c er foretaget under en
antagelse om, at andelen af minkvarianter blandt sekventerede prøver er den samme for
alle påviste tilfælde.
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0007.png
Tabel 1.a:
Region Nordjylland
Antal bekræftede COVID-19-tilfælde, andel af sekventerede prøver, andel af COVID-
19-tilfælde forårsaget af minkvarianten, samt det estimerede antal tilfælde, forårsaget af
minkvarianten pr. uge.
Antal
bekræftede
tilfælde
Antal
Uge 33
Uge 34
Uge 35
Uge 36
Uge 37
Uge 38
Uge 39
Uge 40
Uge 41
Uge 42
Uge 43
Uge 44
Uge 45
Uge 46
Uge 47
Uge 48
Uge 49
Uge 50
Uge 51
Uge 52
Uge 53
Uge 1
60
48
49
68
233
331
292
260
295
330
679
818
588
485
357
267
387
964
1422
1303
1222
984
Sekventerede
prøver
Andel (%) af
bekræftede
52%
40%
51%
41%
19%
23%
27%
15%
16%
42%
6%
29%
37%
63%
68%
63%
17%
10%
21%
27%
21%
18%
Minkvariant
Estimeret antal tilfælde
af minkvarianten
Antal (95% CI)
4 (0-13)
3 (0-12)
14 (6-24)
17 (7-31)
26 (9-57)
26 (10-55)
58 (35-89)
91 (54-134)
176 (131-217)
171 (142-199)
272 (169-385)
180 (138-228)
134 (102-170)
141 (116-167)
117 (96-139)
52 (37-70)
48 (21-90)
40 (11-99)
58 (30-100)
4 (0-21)
19 (5-48)
0 (0-21)
Andel i procent
(95% CI)
6% (1-21)
5% (0-26)
28% (12-49)
25% (11-45)
11% (4-25)
8% (3-17)
20% (12-30)
35% (21-52)
60% (44-74)
52% (43-60)
40% (25-57)
22% (17-28)
23% (17-29)
29% (24-34)
33% (27-39)
20% (14-26)
13% (6-23)
4% (1-10)
4% (2-7)
0% (0-2)
2% (0-4)
0% (0-2)
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0008.png
Tabel 1.b:
Region Midtjylland
Antal bekræftede COVID-19-tilfælde, andel af sekventerede prøver, andel af COVID-
19-tilfælde forårsaget af minkvarianten, samt det estimerede antal tilfælde, forårsaget af
minkvarianten pr. uge
Antal
bekræftede
tilfælde
Antal
Uge 33
Uge 34
Uge 35
Uge 36
Uge 37
Uge 38
Uge 39
Uge 40
Uge 41
Uge 42
Uge 43
Uge 44
Uge 45
Uge 46
Uge 47
Uge 48
Uge 49
Uge 50
Uge 51
Uge 52
Uge 53
Uge 1
428
221
157
137
233
376
670
648
770
677
1186
1294
1321
1601
1722
1529
2233
3720
4316
2807
2798
2044
Sekventerede
prøver
Andel (%) af
bekræftede
43%
45%
39%
45%
12%
22%
15%
13%
14%
31%
5%
14%
18%
17%
18%
22%
18%
12%
15%
11%
11%
14%
Minkvariant
Estimeret antal tilfælde
af minkvarianten
Antal (95% CI)
2 (0-13)
0 (0-8)
0 (0-9)
0 (0-8)
0 (0-29)
0 (0-16)
0 (0-25)
8 (0-43)
15 (2-52)
20 (7-42)
85 (23-205)
146 (92-217)
170 (118-235)
486 (399-580)
477 (392-570)
153 (107-210)
95 (56-150)
73 (34-138)
34 (11-78)
9 (0-49)
9 (0-50)
0 (0-26)
Andel i procent
(95% CI)
1% (0-3)
0% (0-4)
0% (0-6)
0% (0-6)
0% (0-12)
0% (0-4)
0% (0-4)
1% (0-7)
2% (0-7)
3% (1-6)
7% (2-17)
11% (7-17)
13% (9-18)
30% (25-36)
28% (23-33)
10% (7-14)
4% (2-7)
2% (1-4)
1% (0-2)
0% (0-2)
0% (0-2)
0% (0-1)
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9
 MOF, Alm.del - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 576: Spm. om, hvor mange danskere der samlet set har været smittet med en minkvariant af Covid-19, til sundheds- og ældreministeren
2409476_0009.png
Tabel 1.c:
Region Syddanmark
Antal bekræftede COVID-19-tilfælde, andel af sekventerede prøver, andel af COVID-
19-tilfælde forårsaget af minkvarianten, samt det estimerede antal tilfælde, forårsaget af
minkvarianten pr. uge.
Antal
bekræftede
tilfælde
Antal
Uge 33
Uge 34
Uge 35
Uge 36
Uge 37
Uge 38
Uge 39
Uge 40
Uge 41
Uge 42
Uge 43
Uge 44
Uge 45
Uge 46
Uge 47
Uge 48
Uge 49
Uge 50
Uge 51
Uge 52
Uge 53
Uge 1
71
93
96
240
327
377
438
387
358
548
826
1024
990
1088
1454
1298
1433
2119
2966
2211
1925
1652
Sekventerede
prøver
Andel (%) af
bekræftede
48%
44%
49%
53%
21%
45%
49%
23%
13%
27%
5%
17%
18%
15%
18%
15%
16%
25%
16%
24%
27%
22%
Minkvariant
Estimeret antal tilfælde
af minkvarianten
Antal (95% CI)
0 (0-7)
0 (0-8)
0 (0-7)
0 (0-7)
0 (0-17)
0 (0-8)
0 (0-7)
0 (0-16)
0 (0-26)
0 (0-13)
19 (0-99)
18 (4-50)
22 (6-54)
133 (83-199)
185 (130-253)
126 (77-191)
44 (18-90)
8 (1-29)
0 (0-23)
4 (0-23)
0 (0-14)
0 (0-17)
Andel i procent
(95% CI)
0% (0-10)
0% (0-9)
0% (0-8)
0% (0-3)
0% (0-5)
0% (0-2)
0% (0-2)
0% (0-4)
0% (0-7)
0% (0-2)
2% (0-12)
2% (0-5)
2% (1-6)
12% (8-18)
13% (9-17)
10% (6-15)
3% (1-6)
0% (0-1)
0% (0-1)
0% (0-1)
0% (0-1)
0% (0-1)
Øvrige regioner.
I Region Sjælland og Region Hovedstaden er der over de seneste uger
Ikke påvist SARS-CoV-2 minkvariant hos smittede personer.
1
De fleste restriktioner lempes i Nordjylland | Sundheds- og ældreministeriet (sum.dk)
Side 9